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，釋放驪山刑徒，緊急組建中部軍。不久，中部軍擊潰周文軍，出關乘勝東進，逐一消滅陳勝軍主力，攻克張楚首都陳縣。平定了張楚以後，中部軍進入魏國地區，攻克魏國首都臨濟，平定了魏國地區的叛亂。進而再接再厲，擊敗增援魏國的齊軍和楚軍，殺死齊王田儋。幾經勝敗反覆之後，與北部軍聯手在濮陽作戰，擊潰項氏楚軍主力，殺死了項梁。
消滅了黃河南岸各地的叛亂軍主力後，中部軍主力渡過黃河，攻佔了趙國首都邯鄲。然後，一面沿黃河設防，一面修築甬道為圍困鉅鹿的王離軍運糧，準備圍點打援，在鉅鹿一帶聚殲六國援軍。鉅鹿大戰，北部軍全軍覆沒，章邯統領中部軍退守河內安陽。二世三年七月，內外交困的章邯統領二十萬中部軍投降項羽。次年十一月，投降的秦軍在即將進入關中的時候，軍心不穩，遭到項羽所統領的聯軍突然襲擊，被坑殺於新安。至此，中部軍全軍覆沒[6]。
秦帝國的建立，靠的是秦軍多年連續不斷的征戰勝利。與此相應，秦帝國的滅亡，也因為秦軍主力逐一從戰場上消失。南部軍獨立，北部軍被殲滅，中部軍投降以後，秦帝國滅亡的命運已經決定，二世三年八月，秦宣佈放棄皇帝稱號，恢復秦王的名號。秦的這項決定有兩重意義，一是宣佈秦帝國解體，二是希望秦國與六國並存。這個時候的秦國政府，最大的希望就是維持舊秦王國的存在，而支撐這個希望的物質力量，一是舊秦國的本土——關中地區——還在秦政府的手中，二是最後一支秦軍主力部隊——駐守首都地區的京師軍——還完好無損。
京師軍的去向，將決定秦國的命運。