閃文書庫

第22章 開源三維軟體 (第3/3頁)

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機會不動聲色地湊近李旭,壓低聲音向他打探道:“我想問問你,先前那潘氏魚究竟是在哪兒被發現的呀?”面對詢問,李旭也不藏著掖著,竹筒倒豆子般知無不言、言無不盡,將所有相關資訊都一五一十地告知給了翟中和。

李旭緩緩地走進宿舍,他像往常一樣輕輕地坐在椅子上。然後伸出右手,滑動滑鼠,隨著一陣輕微的電流聲響起,電腦螢幕被成功啟用亮起。

李旭定睛一看,發現之前下載的資料已經全部完成了。他那原本緊繃著的臉終於放鬆下來,嘴角也微微上揚露出一絲笑容。

資料檔案採用 PDB(蛋白質資料庫)格式,他熟練地使用兩款開源軟體——Jmol 和 pymol,將資料清晰地呈現為三維立體影象。此外,這兩款軟體還可以任意旋轉三維立體影象,以便觀察任意結構的細節。

開啟資料檔案後,李旭選擇了自己最為熟悉的兩種模式:卡通模式用於觀察整體結構,卡通的展現手法讓分子如動畫中的精靈美侖美奐,可以更直觀地瞭解大分子的全貌;而球棍模式則側重於展示元素組成和原子間化學鍵,每個原子都被纖毫畢現地呈現出來。

當那些清晰明瞭的三維立體影象展現在眼前時,李旭對大分子結構就可以瞭然於心。他的心中頓時湧起一股無法言喻的喜悅之情。這些立體影象傳達的資訊是他和同學們努力的成果,凝聚著大量的辛勤付出。此刻,所有的汗水與堅持都得到了最美好的回報。

當談到如何理解那些諸如座標系、立體幾何和大分子三維結構之類較為抽象的概念時,李旭心裡很清楚,光看資料是遠遠不夠的,還必須得展現出直觀的模型才行。雖然,世界上也存在著那麼一種天才,他們僅需透過資料、二維影象就能在自己的腦海當中成功地構築出一個完整的三維立體影象來。只可惜,李旭心裡明白,他並不是那樣的天才。

對李旭而言,只有三維立體影象才能帶來最直觀的感受。其實這種情況,跟中國歷史上學現代數學的時候非常相似,那時大家也覺得還是直觀一點更好理解。而要說起這個,那就讓李旭想到留學生給李鴻章講拋物線的趣事。

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